1947-1950 гг. – командующий авиационным объединением в Ленинградском военном округе.
1950-1953 гг. – командующий авиационным объединением в Прибалтийском военном округе.
1955-1959 гг. – после окончания Академии Генерального штаба командует авиационным объединением Прикарпатского военного округа.

С августа 1959 до 1971 г. – начальник тыла, член Военного Совета ВВС СССР.

С 1971 года в отставке – принимает активно участие в общественной жизни, неоднократно избирается в различные партийные и государственные органы власти. Участвует в ветеранском движении – член Советского Комитета ветеранов войны, заместитель председателя Совета ветеранов Северо-Западного фронта, заместитель председателя Совета содействия военкомату, член Комитета советско-польской дружбы.

Свыше 30 лет, с 1928 по 1959 гг. – таков летный стаж Героя Советского Союза командарма Ф. П. Полынина, прошедшего славный путь в авиации Вооруженных Сил СССР – от курсанта до генерал-полковника. За свой многолетний путь он испытал самые сложные условия борьбы с врагом. Как летчик Федор Петрович Полынин в совершенстве освоил свыше 30-ти типов различных самолетов, начиная от первых поршневых, кончая современными реактивными.